发布日期:2025-05-24 07:27 点击次数:146
协和神经肿瘤专栏
第107期
文章标题:抗PD-L1治疗新诊断胶质母细胞瘤的总生存期获益与特定的免疫、突变和肠道微生物组相关:一项单臂前瞻性I/II期临床试验
研究背景
GBM是最常见的恶性中枢神经系统肿瘤,标准治疗(手术、放疗联合替莫唑胺化疗)的中位总生存期(mOS)仅为14-16个月,复发后生存期更短(6-9个月)。61%的GBM肿瘤中存在≥1%的程序性死亡配体1(PD-L1)阳性细胞。PD-L1和PD-1的表达是GBM预后不良的指标。遗憾的是,目前PD-1/PD-L1阻断剂对GBM患者的疗效有限,但对存在错配修复缺陷的患者有一定疗效。疗效不佳的原因有很多,包括肿瘤异质性、全身和局部免疫抑制以及肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的富集。
既往针对免疫检查点抑制剂治疗GBM的研究缺乏免疫预测生物标志物和肿瘤全面基因组特征的分析。本研究旨在评估标准治疗(放疗+替莫唑胺)联合抗PD-L1治疗(阿替利珠单抗)在新诊断GBM中的安全性和有效性,并通过多组学分析(肿瘤基因组、转录组、及肠道微生物组测序)探索与生存获益相关的生物标志物,以期为免疫治疗的优化提供依据。
展开剩余87%研究方法
I期为安全性评估,共纳入10名患者;因药物毒性可接受,II期纳入了50名患者。在同步放化疗和辅助化疗阶段,阿替利珠单抗均为每2周静脉注射一次。MRI复查时间:入组登记后2周内,同步放化疗结束后3-4周,辅助化疗阶段每8周复查一次。治疗反应评估采用iRANO标准。
检测内容包括全外显子测序(WES)、转录组测序、宏基因组测序,分析内容包括体细胞拷贝数分析、突变分析、差异基因表达分析、基因富集分析、肿瘤免疫微环境分析、GBM转录亚型分析、肠道微生物组分析。使用的GBM公共数据集包括TCGA和GLASS。
生存期从诊断时间开始计算,但为了分析治疗后生存期与分子特征之间的相关性,分析时采用开始治疗的时间。
研究结果
2017年8月至2019年7月,对78名GBM患者进行了筛选,其中18名未通过筛选,最终60名接受了治疗(图1)。入组患者的基线特征见表1。
图1A:临床试验设计;B:患者入组情况。
表1:入组患者的基线特征。
安全性评价
阿替利珠单抗与放疗和替莫唑胺联合治疗的耐受性普遍良好,在新诊断GBM患者中没有出现任何新的、未报告过的毒性反应。56.7%的患者(34/60)出现了可能或肯定与治疗相关的3级以上的不良反应。最常见的治疗相关不良反应是淋巴细胞减少(38.3%)、血小板减少(8.3%)、谷丙转氨酶(ALT)升高(8.3%)、疲劳、便秘和脑水肿(5%)。1名患者在I期阶段因剂量限制性毒性(DLT)出组,即3级肝炎和3级肺炎,可能与治疗相关。在II期阶段,2名患者因4级肝炎(可能与阿替利珠单抗有关)而出组。临床试验没有在I期提前终止,而是继续进行到II期,最终完成60名患者的入组。
有效性评价
截至2023年5月11日,中位随访时间为51.7个月。在60名患者中,56名为IDH1野生型,4名为IDH1突变型,总的中位总生存期(mOS)为18.0个月。在IDH1野生型组中,56名患者中有50名死亡,mOS为16.1个月。MGMT甲基化组的mOS为25.4个月,MGMT非甲基化组的mOS为14.6个月。在接受治疗的60名患者中,6名(10%)获得完全缓解(CR),8名(13.33%)获得部分缓解(PR),缓解持续时间为13.91个月。
肿瘤基因突变和拷贝数变异情况
对治疗前的IDH1野生型肿瘤(43例)进行了基因突变和拷贝数变异检测,发现最常见的基因突变包括PTEN(53%)、TP53(32%)和EGFR(21%),常见的拷贝数变异包括广泛的7号染色体扩增、部分12q14.1和14q11.2扩增,以及广泛的10号染色体缺失、部分9p21.3/22.2和17p11.2缺失,与既往研究一致。(图2A)
无监督聚类分析发现与抗PD-L1治疗生存期获益相关的关键分子特征
对29例治疗前GBM的全外显子测序(WES)进行无监督聚类分析,发现肿瘤分为两类,A类均携带PTEN突变,B类均不携带PTEN突变,后者EGFR突变频率较高,且PTEN和EGFR同时突变者被归入A类(图2B)。生存分析显示,A类患者的mOS显著高于B类患者(图2C)。
对转录组测序进行无监督聚类分析,发现肿瘤也分为两类(1类和2类),1类肿瘤表现为C1QA、C1QB、FCER1G和胶原1A1、1A2 和 3A1表达上调(图2D)。生存分析显示,1类患者的mOS显著高于2类患者(图2E)。
对拷贝数变异进行无监督聚类分析和生存分析,没有发现不同拷贝数变异组有显著生存期差异。
图2:治疗前GBM肿瘤的分子特征。A:基因突变热图。B:基于肿瘤基因突变的的无监督聚类。C:EGFR突变、PTEN突变GBM肿瘤患者OS的K-M曲线。D:基于肿瘤转录组测序的无监督聚类。E:1类与2类GBM肿瘤患者OS的K-M曲线。
基于mOS分层的基因富集分析(GSEA)
以mOS=16.1个月为截点区分长OS组和短OS组,基因富集分析(GSEA)发现较长OS患者的肿瘤表现为免疫相关基因的富集,尤其是与干扰素γ和炎症反应以及抗原呈递相关的通路(图3A)。对特异性免疫标志物的转录组分析显示,较长OS患者的肿瘤中CD14、CD86、CCR2、CCR5、HLA-A和HAVCR2表达上调(图3B)。细胞溶解评分(cytolytic score)是已知与免疫检查点抑制剂临床获益相关的关键免疫学特征,该评分在较长OS患者的GBM肿瘤中也有所升高(图3C)。
图3:与mOS分层相关的基因转录组分析。A:长OS组与短OS组患者的肿瘤转录组热图。B:长OS组与短OS组患者肿瘤的代表性差异基因。C:长OS组与短OS组患者肿瘤的细胞溶解评分(cytolytic score)。
高度免疫浸润的GBM肿瘤与特定的免疫细胞类型、GBM间质亚型和肠道微生物组特征相关
计算肿瘤的ESTIMATE免疫评分(ESTIMATE Immune Score,EIS),根据中位数分为低EIS组和高EIS组。生存分析显示,低EIS组患者的mOS为14.5个月,而高EIS组患者的mOS为24.8个月,存在显著差异。但是,在公共数据库TCGA和GLASS提取的未接受免疫治疗的IDH1野生型GBM患者队列中,EIS无法显著区分患者预后(图4A)。
通过Xcell免疫去卷积算法推测肿瘤中的免疫细胞类型,发现高EIS组肿瘤中的大多数细胞类型都含有髓系标志物:活化的树突状细胞、单核细胞、巨噬细胞,尤其是M1型巨噬细胞。此外,高EIS组肿瘤中增多的淋巴系细胞类型是CD4+效应记忆T细胞(图 4B、C)。生存分析显示,肿瘤中表达PD-L1的细胞毒性(CD3+CD8+)T细胞比例较高的患者的mOS期较长(图4D)。
通过转录组分析将IDH1野生型GBM 肿瘤分为原神经亚型、经典亚型和间质亚型,分别占比为28.2%、41.0% 和 30.7%(图4E)。分析发现,间质亚型GBM的免疫细胞含量更丰富,91.7%为高EIS。生存分析显示,接受抗PD-L1治疗的间质亚型GBM肿瘤患者的mOS值高于原神经亚型和经典亚型,mOS分别为26.5个月、15.5个月、15.6个月。
图4:与抗PD-L1治疗患者OS分层相关的特异性免疫浸润特征。A:对3个患者队列(本研究、TCGA、GLASS)中高EIS组和低EIS组进行生存分析的K-M曲线。B:高EIS组和低EIS组肿瘤中的免疫细胞类型推断。C:高EIS组和低EIS组肿瘤中的主要差异免疫细胞类型。D:根据肿瘤中CD3+CD8+细胞PD-L1表达水平比较患者OS的K-M曲线。E:GBM间质亚型与原神经亚型、经典亚型相比,与高EIS和长OS相关。
对患者治疗前的粪便样本进行肠道微生物组分析,结果发现较长OS患者的肠道微生物显示出相似的α多样性水平(该指标用于评估样本内多样性)(图 5A、B)。通过主坐标分析(PCoA)评估β多样性水平(该指标用于评估样本间多样性),发现较长患者OS患者肠道微生物成分倾向于聚在一起,与较短OS患者的肠道微生物成分分开(图5C)。通过ANCOM-BC进行差异丰度分析,发现较长OS患者中富集的菌群主要为厚壁菌门芽孢杆菌属(图5D)。
图5:患者肠道微生物组特征与总生存期相关。A:长OS和短OS患者的肠道微生物组α多样性水平分析。B:长OS和短OS患者的肠道微生物组的菌群类型和相对丰度。C:长OS和短OS患者的肠道微生物组β多样性水平分析。D:长OS患者肠道的主要流行菌种。
免疫浸润特征和EGFR突变是抗PD-L1治疗后OS的独立预测因素
纳入EIS评分、EGFR突变状态、MGMT启动子甲基化状态、手术切除程度、年龄、性别和KPS评分的多变量分析显示,高EIS与较长的OS独立相关,EGFR突变与较短的OS独立相关(图6A)。图6B总结了本研究的发现。
图6:肿瘤免疫浸润特征和EGFR/PTEN突变状态可独立预测抗PD-L1治疗的GBM患者的 OS获益。A:纳入EIS评分、EGFR突变状态、MGMT启动子甲基化状态、手术切除程度、年龄、性别和KPS评分的多变量分析。B:抗PD-L1治疗后与较长OS相关的肿瘤内在特征和肠道微生物组特征。
研究结论
对于接受抗PD-L1治疗后有OS获益的新诊断GBM患者,肿瘤可检测出PTEN突变,治疗前的肿瘤中具有更多的活化树突状细胞、M1巨噬细胞、CD4+效应记忆T细胞、细胞毒性T细胞,在治疗前的肠道菌群中存在一些菌种的富集。
参考文献:
本期译者
北京协和医院神经外科、北京协和医院外科学2024级博士研究生王海
本期编审
北京协和医院神经外科主任医师王裕副教授,医学博士、留美博士后
发布于:北京市
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